Bị bệnh gan nặng nhưng tâm hồn đầy thanh thản, bình yên, cha thánh I Nhã lìa đời ngày 31 tháng 7 năm 1556 trong căn phòng tĩnh lặng chỉ có chính cha với Thiên Chúa. Lúc sinh thời, cha I Nhã Loyola tha thiết ước mong đem đến cho mọi người tin mừng về Thiên Chúa và để mọi người nhận biết rằng Thiên Chúa thương con người, đã sai Con Một yêu dấu của Ngài làm người. Tin Mừng về Chúa Kitô bị đóng đinh chết và sống lại để giải thoát, kêu gọi loài người trở về sự thánh thiện nguyên thủy và mời gọi con người sống mãi với Thiên Chúa. Giáo Hội cũng chỉ loan báo tin mừng này, nhưng cha I Nhã, dựa vào kinh nghiệm bản thân, có một phương thế đặc biệt để giúp nhiều người nhận thấy Tin Mừng như một kinh nghiệm bản thân.
(Xin phép được bổ sung thêm bạn nhé!) Trong lời lẽ của ngài người ta vẫn thấy tiềm ẩn của sự đại kết. Phải rất thận trọng khi đưa ra các chân lý chính truyền, để nếu người lạc giáo có mặt ở đó, họ se cảm nhận được lòng bác ái và sự ôn hòa của Kitô Giáo. Không được dùng lời lẽ cứng rắn và cũng không được khing miệt những sai lầm của họ.
Thánh I Nhã đề nghị lời khuyên sau đây cho các hối nhân: Lạy Chúa xin hãy chấp nhận mọi đặc quyền, mọi ký ức, mọi hiểu biết và toàn thể ý chí của con. Ngài đã ban cho con tất cả những gì con có, tất cả con người của con, và con xin phó thác chúng cho thành ý của Ngài, để Ngài tùy ý sử dụng. Con chỉ xin Chúa ban cho con tình yêu và ơn sủng. Được như thế con, con đã giàu sang đủ và không dám đòi hỏi gì nữa.